1. Mengandung Gugus Phosphate (P), Gula deoksiribosa, dan basa N
2. Mengikuti hukum Chargaff: jumlah (A-T) + jumlah (G-C) = 100%
3. Antar basa N diikat dengan ikatan H
4. Sudut antara C1 dengan N Thymine: 50°
5. Sudut antara C1 dengan N Adenine: 51°
6. Sudut antara C1 dengan N Cytosine: 52°
7. Sudut antara C1 dengan N Guanine: 54°
8. Jarak ikatan H antara A-T: No. 6 dengan No. 4 = 2,85 Å; No. 1 dengan No. 3 = 2,90 Å
9. Jarak ikatan H antara G-C: No. 6 dengan No. 4 = 2,83 Å; No. 1 dengan No. 3 = 2,86 Å; No. 2 dengan No. 2 = 2,84 Å.
10. Jarak ikatan antar atom gula C1 pada basa N A-T: 11,1°
11. Jarak ikatan antar atom gula C1 pada basa N G-C: 10,8°
12. Kerangka gula deoksiribosa dan gugus phosphate berada di luar sedangkan basa N ada di dalam untaian (helix)
13. Diameter = 20 Å (angstrom)
14. Jarak antar pasangan basa N = 3,4 Å
15. Putaran rotasi = 36°
16. BM: 660 dalton (D)
17. Variasi struktur DNA
Tipe Untaian
| ||||
A
|
B
|
C
|
Z
| |
Arah putaran
|
Putar kanan
|
Putar kanan
|
Putar kanan
|
Putar kiri
|
Diameter
|
~ 23 Å /~26 Å
|
~ 20 Å
|
~ 19 Å
|
~18 Å
|
Pasangan basa/putaran
|
11
|
10
|
9,33
|
12 (6 dimer)
|
Rotasi/bp
|
+32,7° / +33°
|
+36°
|
+38,6°
|
–30° / 60° (per dimer)
|
Jarak antar pasangan basa N
|
2,6 Å
|
3,4 Å
|
45 Å
| |
Panjang satu putaran helix
|
28 Å
|
34 Å
|
45 Å
| |
Kemiringan normal basa terhadap sumbu untaian
|
20°
|
6°
|
7°
| |
Major groove
|
Sempit dan dalam
|
Lebar dan dalam
|
datar
| |
Minor groove
|
Lebar dan dangkal
|
Sempit dan dalam
|
Sempit dan dalam
| |
Ikatan glikosida
|
Anti*
|
Anti*
|
Anti* (pirimidin);
Syn** (purin)
| |
Bentuk gula
|
C3’ endo
|
C2 endo’
|
C2’ (pirimidin);
C3’ (purin)
| |
*Anti: rotasi geometri antara ikatan gliksosida N-C1 sebesar 180°
** Syn: rotasi geometri antara ikatan gliksosida N-C1 kurang dari 180°
0 Komentar untuk "KARAKTERISTIK DNA"